Nositelj projekta: KBC Osijek, J. Huttlera 4, 31 000 Osijek
Naziv projekta: Istraživanje i dijagnostika malignih, infektivnih i rijetkih metaboličkih bolesti temeljena na MALDI TOF tehnologiji
Izvor financiranja: Europski fond za regionalni razvoj
Operativni program: Operativni program „Konkurentnost i kohezija 2014. – 2020.“
Voditelj projekta: izv.prof.dr. Željko Debeljak, mag., spec. med. biokemije, voditelj Odjela za kliničku kemiju, Klinički bolnički centar Osijek
Projektni tim:Svi članovi tima su zaposlenici KBC Osijek.
Kontakt osoba: Nikolina Varda, mag. iur.
Sažetak projekta: Projekt ima za cilj osigurati uvjete za modernizaciju znanstveno- istraživačkog rada pri KBC Osijek ulaganjem u materijalnu imovinu, odnosno nabavu masenog mikroskopa i MALDI TOF/TOF masenog spektrometra i popratne opreme, te pripadajućom prilagodbom prostora za postavljanje kupljene instrumentacije. Na taj će se način istraživački i znanstveni potencijal KBC Osijek lakše realizirati te će se učiniti slijedeći korak u razvoju zdravstvenog sustava temeljenog na znanju.
Ulaganje u ovaj projekt ključno je za dostizanje vrhunske kvalitete istraživačkih djelatnosti u KBC Osijek te direktno pridonosi unaprijeđenju dijagnostike i razumijevanju nastanka te razvoja metastatske bolesti, a koje bi rezultiralo učinkovitijom terapijom malignih bolesti, prvenstveno karcinoma dojke u gradu Osijeku, Osječko-baranjskoj županiji i Republici Hrvtaskoj.
Nabava navedene opreme doprinijela bi i unaprijeđenju dijagnostike rijetkih nasljednih bolesti iz grupe lipidoza te unaprijeđenju dijagnostike sepse što bi rezultiralo ranijim otkrivanjem te učinkovitijom terapijom oboljelih. Projektom će se svladati problemi s kojima je suočen sustav istraživanja i razvoja u KBC Osijek uzrokovan nedovoljnom
kvalitetom istraživačke opreme i pripadajuće infrastrukture, a posljedično i neprimjerenim korištenjem znanstvenih potencijala (ljudskih resursa). Stručnu podršku potrebnu za kvalitetno ostvarenje zadanih ciljeva KBC Osijek će imati od Ministarstva zdravstva koje podržava projekt.
Također, za više informacija o EU fondovima, posjetite
www.strukturnifondovi.hr
Značaj javne dostupnosti opreme nabavljene putem projekta širem krugu istraživača je potvrđen i u kolaboraciji s istraživačkom grupom doc.dr. Srećka Kirina iz Instituta Ruđer Bošković, Zagreb: u niže prikazanoj publikaciji objavljenoj u svibnju 2024. prikazani su rezultati potvrde identiteta novosintetiziranih spojeva rutenija za što je korištena MALDI TOF MS tehnologija. Ova kolaboracija je pokazuje kako…
Izuzetno kompleksno istraživanje međunarodne skupine istraživača, čiji smo i mi bili dio, je pokazalo smanjenje kardiotoksičnosti citostatika doksorubicina u slučaju uporabe novih nanoformulacija ovog lijeka. Do tih zaključaka se došlo, između ostalog, primjenom MALDI TOF IMS uređaja nabavljenih putem projekta: rezultati istraživanja su objavljeni u niže-prikazanoj publikaciji u časopisu s vrlo visokim čimbenikom odjeka.
Kolege kirurzi, Bojan Trogrlić, dr.med. i Ana Bednjanić, dr.med. iz Klinike za kirurgiju, KBC Osijek, u ožujku 2024. godine nastavljaju razvoj primjena MALDI TOF IMS tehnologije u dijagnostici karcinoma kolona. Na slici niže su prikazani srednji spektri masa tumora i peritumora snimljeni u bioptatu karcinoma kolona oboljele osobe na kojima se jasno vide razlike u…
U veljači 2024. godine je obranjena još jedna tema disertacije koja se temelji na primjeni MALDI TOF IMS uređaja nabavljenih putem projekta: abdominalna kirurg, Bojan Trogrlić, dr.med., Klinika za kirurgiju, KBC Osijek nam se pridružio u istraživanju primjena ove tehnologije u dijagnostici karcinoma kolona.
Iznimni interes za provedbu istraživanja primjenom tehnologije nabavljene putem projekta se nastavlja. U siječnju 2024. nam se pridružila Ema Pavičić, mr.ph., asistentica na studiju Farmacije Sveučilišta JJ Strossmayera u Osijeku. Kolegica (slika niže) je započela pripreme za istraživanja namijenjena izradi doktorske disertacije koje provodi na Bruker UltrafleXtreme uređaju nabavljenom putem projekta.
Opravdanost investicije u MALDI TOF IMS tehnologijiu je dobila još jednu potvrdu u prosincu 2023. godine: Hrvatska zaklada za znanost je prihvatila naš projekt “Leukocitni metabolički biljezi u kroničnoj limfocitnoj leukemiji prostorno razlučeni slikovnom spektrometrijom masa” za financiranje u periodu od 2025-2029 u iznosu od cca 130 000 eura. Nadalje, u studenom 2024.…
Listopad 2023. godine je donio brojne nagrade za uloženi trud. Naš suradnik i kolega Jurica Baranašić, doktorand zaposlen na Institutut Rugjer Bošković, Zagreb, je uspješno obranio svoju doktorsku disertaciju a kolega i suradnik Edi Rođak, doktorand Medicinskog fakulteta u Osijeku, je promoviran u doktora znansti: u izradi obje disertacije korišteni su MALDI TOF MS uređaji…
U okviru suradnje s istraživačkom grupom Jelene Knežević sa Instituta Rugjer Bošković, Zagreb provodimo procjenu točnosti prepoznavanja promjene aktivnosti enzima koja se temelji na MALDI TOF MS tehnologiji. U tu svrhu je doktorand Jurica Baranašić u kolovozu 2023. godine pripremio različite stanične kulture s utišanim genima koji kodiraju nekolicinu enzima. Primjer takvog eksperimenta je prikazan…
Početkom 2023. godine smo započeli suradnju s izv.prof.dr. Igorom Lukačevićem s Odjela za fiziku Sveučilišta JJ Stossmayera u Osijeku. Cilj suradnje je izračun svojstava fosfolipida primjenom kvantne-mehanike. Pozdano izračunata svojstva navedenih molekula bi nam olakšala identifikaciju pojedinačnih fosfolipida pomoću MALDI TOF/TOF IMS postupaka za analizu lipida u limfocitima. Tijekom srpnja 2023. godine prof. Lukačević je…
Dr.sc. Nikolina Kalčec, Institut za medicinska istraživanja i medicinu rada, Zagreb je sudjelovala na kongresu “Recent achievements in nanotechnology – 10th anniversary of BNT Center University of Bialystok” održanom u Poljskoj početkom lipnja 2023. godine. Nikolina je na kongresu imala postersku prezentaciju rezultata istraživanja nanočestičnih formulacija doksorubicina dobivenih pomoću opreme nabavljene putem projekta. Na slici…
Tijekom svibnja 2023. godine u Rimu je održan kongres Evropske federacije za kliničku kemiju i laboratorijsku medicinu te Internacionalne federacije za kliničku kemiju. Na navedenom kongresu prikazan je i poster Ivane Marković, doktorandice Medicinskog fakulteta Sveučilišta u Osijeku. Odabrane slike s postera prikazane su ovdje. Na slikama se može uočiti da MALDI TOF IMS tehnologija…
Na danima doktoranada Medicinskog fakulteta Sveučilišta JJ Strossmayera u Osijeku održanim u travnju 2023. godine doktorandica Ivana Marković iz Kliničkog zavoda za laboratorijsku dijagnostiku, KBC Osijek je prezentirala rezultate svojih istraživanja: slike prikazuju snimke CD19+ limfocita dobivene fluorescentnim i masenim mikroskopom iMScope TRIO (Shimadzu, Japan). Navedene snimke su dobivene tijekom optimizacije postupaka za analizu pojedinačnih…
Višegodišnja suradnja s istraživačkom grupom prof.dr. Marije Heffer sa Medicinskog fakulteta Sveučilišta JJ Strossmayera u Osijeku na istraživanju učinaka antidijabetika na različita tkiva pokusnih životinja rezultirala je novim saznanjima o tkivno-specifičnim metaboličkim promjenama izazvanim navedenim lijekovima. Za navedena istraživanja korišten je i uređaj iMScope TRIO (Shimadzu, Japan) nabavljen putem projekta: toplinska karta (engl. heat map)…
Suradnja s Institutom za medicinska istraživanja i medicine rada, Zagreb na ispitivanju nanočestičnih formulacija ibuprofena se nastavila i tijekom veljače 2023. godine: dr.sc. Dejan Karaica i dr.sc. Maja Beus su proveli ispitivanja distribucije ibuprofena i njegovih metabolita te njihovih učinaka na različita tkiva pokusnih životinja. Slika prikazuje spektar masa hidroksiibuprofena, jednog od metabolita ibuprofena, snimljen…
U siječnju 2023. godine je objavljena još jedna znanstvena publikacija proizašla iz nabave opreme putem projekta:
U prosincu 2022. godine pripremljeno je godišnje izvješće o korištenju opreme koja je nabavljena putem projekta: izvješće je predano institucijama nadležnim za praćenje učinaka projekta. Nižeprikazani tablični prikaz daje uvid u radne sate provedene u radu s opremom nabavljenom putem projekta. Iz prikazane tablice je uočljiv značajn doprinos MALDI TOF IMS uređaja ultrafleXtreme (Bruker Daltonics,…
Tijekom studenog 2022. godine u Kliničkom zavodu za laboratorijsku dijagnostiku, KBC Osijek su boravile Nikolina Kalčec i Nikolina Peranić, doktorandice Instituta za medicinska istraživanja i medicinu rada, Zagreb. U okviru višegodišnje suradnje u razvoju nanočestičnih formulacija lijekova, kolegice su optimirale i validirale metodu za mjerenje koncentracije ibuprofena u plazmi temeljenu na tekućinskoj kromatografiji: metoda je…
Biokemičari Kliničkog zavoda za laboratorijsku dijagnostiku, KBC Osijek su sudjelovali u organizaciji dolje navedenog skupa održanog 27.09. – 01.10.22. u Zagrebu. Osim u ulozi organizatora ovog međunarodnog kongresa kolege su sudjelovali i u ulozi predavača. Od predavanja održanih od strane članova projektnog tima izdvajamo predavanje koje je održao Izv.prof.dr. Željko Debeljak naslovljeno “Diagnostic Applications of…
Kolegica Ivana Marković, doktorandica Medicinskog fakulteta u Osijeku i zaposlenica Kliničkog zavoda za laboratorijsku dijagnostiku, KBC Osijek, je u okviru znanstvenog istraživanja namjenjenog izradi doktorske disertacije, pripremila preliminarne rezultate razlikovanja CD19+ B limfocita porijeklom od bolesnika s kroničnom limfocitnom leukemijom i CD19+ B limfocita porijeklom od zdravih donora. Navedeno razlikovanje je provedeno pomoću MALDI TOF…
Nakon objavljivanja prikaza primjene slikovne spektrometrije masa u razvoju novih formulacija lijekova navedena tehnologija je primjenjena za proučavanje učinka citostatika doksorubicina na tkiva poput srca i jetre. Dolje je prikazana jedna od slika prostorne raspodjele biljega oksidativnog stresa srčanog mišića štakora izloženog utjecaju doksorubicina snimljena u okviru suradnje s dr. I Vinković Vrček i s…
Istraživanje i dijagnostika nasljednih metaboličkih bolesti su navedeni kao neki od ciljeva projekta. Također, među ciljevima projekta je navedeno širenje znanstveno-istraživačke mreže i suradnje. U svrhu postizanja oba cilja uspješno je završena suradnja sa znanstvenicima iz KBC Zagreb i KBC Split te Nizozemske i Belgije s ciljem unaprijeđivanja razumijevanja patofiziologije te unaprijeđenja dijagnostike jednog rijetkog…
Jedna snimka dobivena slikovnim spektrometrom masa sadrži od nekoliko stotina megabajta do nekoliko gigabajta informacije. Stoga je analiza nekolicine snimki takvih snimki, čak i uz pomoć računala, dugotrajna. Nekoliko mjeseci nakon snimanja preparata karcinoma kolona mogu se izvući prvi zaključci. Na niže prikazanoj snimci jednog od analiziranih preparata karcinoma kolona može se uočiti da nenadzirana…
Neke od mjera produktivnosti istraživanja koje se prate u svrhu procjene opravdanosti provedbe projekta su broj i citiranost znanstvenih publikacija ostvarenih na temelju primjene nabavljene opreme te čimbenici utjecaja znanstvenih časopisa u kojim se onavedene publikacije objavljuju. U lipnju 2022. je objavljena još jedna znanstvena studija u uglednom međunarodnom časopisu proizašla iz naše suradnje s…
Suradnja sa dr. I. Vinković Vrček, Institut za medicinska istraživanja i medicinu rada uključuje i farmakokinetičke studije. U svrhu usporedbe farmakokinetičkih profila konvencionalnih i nanoformulacija ibuprofena je potrebno implementirati i validirati analitički postupak za tu namjenu. Nakon prethodno navedenih koraka razvoja i optimizacije kromatografskog analitičkog postupka postignuti su zadovoljavajući predanalitički i analitički uvjeti. Na slici…
Osiguranje kvalitete je presudno za pouzdanost odnosno reproducibilnost rezultata dobivenih u znanstveno-istraživačkim i dijagnostičkim analizama. Kako bismo osigurali pouzdanu identifikaciju mikroorganizama periodički analiziramo uzorke dobivene od poznatih mikroorganizama što je niže prikazano: podudaranje spektara mase iz baze mikroorganizama i dobivenog spektra mase potvrđuje pouzdanost identifikacije. Testiranje identifikacije mikroorganizama primjenom ultrafleXtreme (Bruker Daltonics, Njemačka) MALDI TOF…
15-18. ožujka 2022. održana je u „on-line“ obliku 6. konferencija o preanalitičkoj fazi Evropske federacije za laboratorijsku medicinu na kojoj je postersku prezentaciju imala i doktorandica Ivana Marković. U okviru naših višegodišnjih nastojanja u razvoju slikovne spektrometrije masa krvnih stanica kolegica Marković je provela ispitivanje uvjeta pripreme uzoraka za snimanje spektara masa leukocita pomoću uređaja…
Tijekom veljače i ožujka 2022. godine se nastavlja suradnja s Institutom za medicinska istraživanja i medicinu rada, Zagreb. dr. Vinković Vrček sa suradnicima se bavi razvojem nanoformulacija lijekova što uključuje i nanoformulacije ibuprofena. Kako bi se ispitala biološka, konkretno, farmakokinetska svojstva nanoformulacija ibuprofena bilo je potrebno uvesti postupak za mjerenje koncentracije ibuprofena u krvi. Doktorandice…
Potvrda identiteta novosintetiziranih kemijskih spojeva te ispitivanje njihove čistoće su nužni postupci u organskoj i medicinskoj/farmaceutskoj kemiji koji prethode ispitivanjima njihovog biološkog učinka. Grupa doc.dr.sc. Srećka Kirina iz Instituta Ruđer Bošković, Zagreb je jedna od grupa u RH koja se bavi sintezama novih kemijskih spojeva te ima potrebu za identifikacijom novosintetiziranih produkata. Tijekom siječnja 2022.…
Tijekom prosinca 2021. godine pripremljeno je godišnje izvješće o aktivnostima temeljenim na primjeni laboratorijske opreme nabavljene putem projekta. Iz izvješća je vidljiv značajan broj suradnih laboratorija i ustanova što ukazuje na postojanje interesa za primjenu opreme nabavljene putem projekta u široj znanstvenoj zajednici u RH. Također, u ovogodišnjem izvješću je uočen porast korištenja opreme u…
Disipacija znanja je jedan od očekivanih učinaka projekta. Stoga se diplomandi, doktorandi i poslijedoktorandi iz različitih znanstvenih institucija uključuju u provedbe istraživačkih studija koje koriste opremu nabavljenu putem projekta. Tijekom listopada i studenog 2021. su dr.sc. Maja Beus i Barbara Pem (na slici) iz Instituta za medicinska istraživanja i medicinu rada posjetile Klinički zavod za…
Male molekule poput koenzima A je teže pouzdano identificirati u biološkom uzorku u odnosu na veće molekule čije molekulske mase prelaze 1 kDa. Nasljedne metaboličke bolesti najčešće podrazumjevaju nakupljanje ili izostanak upravo malih molekula u pojedinim tkivima. Stoga se, u sklopu dijagnostičke obrade bolesnika s nasljednim metaboličkim bolestima, pojavila potreba za primjenom naprednijih, fragmentacijskih tj…
U odnosu na MALDI TOF MS istraživanja malih molekula istraživanja velikih molekula poput peptida i proteina su nešto zahtjevnija, prvenstveno u pogledu pripreme uzoraka. S druge strane, istraživanja proteina daju jasnije odgovore na pitanja o mogućim uzrocima nastanka bolesti nego što je to slučaj s malim molekulama. Slike prikazuju raspodjelu jednog peptida u presjeku tkiva…
Znanstveni skepticizam je temelj znanosti i osigurava joj vjerodostojnost a osnova skeptičkog pristupa rezultatima znanstvenih istraživanja je validacija postupaka pomoću kojih su navedeni rezultati dobiveni. Tijekom srpnja i kolovoza 2021. godine smo pokrenuli suradnju s Institutom Rugjer Bošković u cilju validacije bioinformatičkih postupaka za prepoznavanje promjena biokemijskih procesa u stanici. Na slici su prikazani m/z…
Tijekom srpnja je obranjena prva doktorska disertacija koja je uključivala primjenu MALDI TOF MS analiza provedenih opremom nabavljenom putem projekta. Riječ je o disertaciji pod naslovom “Utjecaj promjene sastava glikolipida stanične membrane na sastav lipidnih splavi stanica ljudskog neuroblastoma SHSY-5Y” kolege Milorada Zjalića (na slici) koji je dio tima znanstvenika Medicinskog fakulteta u Osijeku s…
Kako je riječ o znanstveno-istraživačkom infrastrukturnom projektu glavni cilj je povećanje znanstvene produktivnosti što nužno podrazumijeva i ojačavanje znanstveno-istraživačke mreže. Vođeni tim ciljevima ostvarili smo suradnju s medicinskim fakultetima u Osijeku i Zagrebu te Sveučilištem Johns Hopkins u Baltimore-u što je rezultiralo zajedničkom publikacijom: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jnc.15446
Jedan od ciljeva projekta je istraživanje i razvoj laboratorijske dijagnostike nasljednih metaboličkih bolesti. Pošto je broj osoba oboljelih od većine nasljednih metaboličkih bolesti vrlo mali potreban je razvoj individualiziranih dijagnostičkih pristupa za pojedine bolesnike. Visoka složenost takve dijagnostike te mali broj osoba oboljelih od pojedinih nasljednih metaboličkih bolesti zahtjevaju povezivanje više kliničkih institucija. U tu…
Suradnja s Medicinskim fakultetom Sveučilišta JJ Strossmayera se nastavila i u travnju 2021. godine. U svrhu izrade doktorske disertacije Milorada Zjalića bilo je potrebno utvrditi identitet gangliozida prisutnih u pripravcima staničnih kultura ljudskog neuroblastoma tretiranih inhibitorima sinteze glikosfingolipida. Gangliozidi su molekule prisutne u većini stanica a značajni su za međustaničnu signalizaciju što se prvenstveno odnosi…
Neki od ciljeva projekta „Istraživanje i dijagnostika malignih, infektivnih i rijetkih metaboličkih bolesti temeljena na MALDI TOF tehnologiji“ su ostvarivanje suradnje s drugim znanstveno-istraživačkim institucijama te edukacija studenata i poslijediplomanada. Oba navedena cilja su obuhvaćena istraživanjem u svrhu pripreme diplomskog rada Magdalene Kratofil, studentice Sveučilišta u Rijeci pod naslovom „Metabolička karakterizacija bioptata karcinoma kolona primjenom…
Uvođenje nove tehnologije poput MALDI TOF MSI je često zahtjevno. To se prvenstveno odnosi na prilagođavanje tehnologije za nove namjene. U svrhu razvoja primjene MALDI TOF MSI u dijagnostici metaboličkih bolesti potrebno je nedvojbeno utvrditi identitet pojedinih metabolita. U tu svrhu je bilo potrebno razviti metode fragmentacije molekula metabolita od interesa. Tijekom veljače 2021. godine…
Nekoliko je preduvjeta za rutinsku primjenu MALDI TOF MSI tehnologije u dijagnostici metaboličkih bolesti. Prije svega potrebno je pokazati da navedena tehnologija može identificirati kemijske promjene u vrlo malim objektima poput krvnih stanica do kojih se dolazi neinvazivnim postupcima. U tu je svrhu provedeno istraživanje „MALDI TOF Mass Spectrometry Imaging of Blood Smear: Method Development…
Jedan od ciljeva projekta „Istraživanje i dijagnostika malignih, infektivnih i rijetkih metaboličkih bolesti temeljena na MALDI TOF tehnologiji“ je i edukacija stručnjaka iz područja laboratorijske dijagnostike o primjeni MALDI TOF MS tehnologije. U tu je svrhu, u okviru tečaja trajne edukacije medicinskih biokemičara „Izabrane teme iz laboratorijske morfološke hematologije“ koji je održan u prosincu 2020.…
Projekt „Istraživanje i dijagnostika malignih, infektivnih i rijetkih metaboličkih bolesti temeljena na MALDI TOF tehnologiji“ je uključivao nabavu znanstveno-istraživačke opreme dok dugotrajniji npr. građevinski radovi nisu bili predmet ovog infrastrukturnog projekta. Stoga je ovo jedan od projekata koji su završeni u relativno kratkom roku te je, već krajem 2019. godine, započelo praćenje učinaka projekta. U…
Inicijativa za prijavu projekta „Istraživanje i dijagnostika malignih, infektivnih i rijetkih metaboličkih bolesti temeljena na MALDI TOF tehnologiji“ je potekla iz svakodnevne obrade bolesnika za koje ne postoje adekvatni dijagnostički postupci. Osim u dijagnostici, potrebe za primjenom ove tehnologije postoje i u drugim disciplinama poput istraživanja i razvoja lijekova. Voditelj projekta, Željko Debeljak, je opisao…
Osnovni ciljevi infrastrukturnih projekata u znanosti su ojačavanje znanstveno-istraživačkog rada te znanstveno-istraživačke suradnje. U rujnu 2020. je ostvarena suradnja temeljena na primjeni opreme nabavljene putem projekta sa još jednom znanstveno-istraživačkom institucijom izvan Republike Hrvatske: ostvarena je suradnja sa Sveučilištem u Ljubljani u području istraživanja bolesti jetre. Na slici je prikazana raspodjela hema u jetri miša:…
U određenim situacijama je potrebno molekule od interesa odvojiti od ostalih molekula prisutnih u uzorku prije negoli ih se identificira primjenom MALDI TOF masene spektrometrije. U tu je svrhu u kolovozu 2020. stavljen u funkciju tekućinski kromatograf (Agilent, USA), još jedan od uređaja nabavljen putem projekta. Na slici je prikazano odvajanje biomarkera metaboličkih bolesti kostiju…
Među ciljevima projekta su navedeni detekcija cirkulirajućih tumorskih stanica prisutnih u krvotoku te dijagnostika nasljednih metaboličkih bolesti koje se temelje na primjeni MALDI TOF MS tehnologije. Preduvjet za to je razvoj metode za MALDI TOF maseno spektrometrijski slikovni prikaz stanica krvi. Taj je razvoj započet korištenjem krvnih razmaza. Na slici je prikazana prostorna raspodjela hema…
U okviru projekta je predviđena suradnja s drugim znanstvenim institucijama, prvenstveno Medicinskim fakultetom Sveučilišta JJ Strossmayera u Osijeku. Jedan od ciljeva je povećati broj diplomskih i doktorskih radova koji se izvode u KBC Osijek. Prvi diplomski rad čija je provedba uključivala primjenu opreme nabavljene putem projekta je obranjen u lipnju 2020. Na slici je prikazan…
U svibnju 2020. je nastavljena istraživačka suradnja s Institutom za medicinska istraživanja i medicinu rada. Cilj istraživanja je utvrditi toksičan učinak određenih citostatika na metaboličku funkciju različitih organa. Na slici je prikazan utjecaj primjene citostatika na distribuciju palmitoilkarnitina u srčanom mišiću: uočljivo je značajno povećanje sadržaja ovog biomarkera oksidacije masnih kiselina uslijed primjene citostatika. Snimke…
Tijekom cijele 2020 godine je tekla suradnja sa Institutom za mozak, Zagreb, Medicinskim fakultetom Sveučilišta JJ Strossmayera u Osijeku i Johns Hopkins Sveučilištem iz Baltimore-a, USA u području analize lipidnog sastava mozga. Na slici je prikazana ukupna struja lipidnih iona u presjeku malog mozga miša: jasno su uočljive razlike u intenzitetima signala lipida i malih…
Unaprjeđenje mikrobiološke dijagnostike je jedan od ciljeva projekta. U ožujku 2020. je započela primjena uređaja ultrafleXtreme, Bruker Daltonics, USA u mikrobiološkoj dijagnostici. Na slici je prikazan spektar masa uzorka bakterijske kulture nepoznatog identiteta koji omogućava njenu identifikaciju. Uvođenje ove tehnologije predstavlja značajan iskorak u dijagnostičkoj obradi osoba oboljelih od zaraznih bolesti.
Tijekom studenog su kolege doc.dr. Ksenija Marjanović, doc.dr. Željko Debeljak i Božidar Stojanac posjetile evropsko sjedište tvrtke Shimadzu u Muensteru, Njemačka. Tom prilikom kolege su prošle edukaciju iz primjene MALDI TOF MS slikovne tehnologije u u različitim područjima biomedicinskih istraživanja. Petodnevna edukacija se temeljila na primjeni uređaja iMScope Trio, Shimadzu u navedene svrhe. Edukacija je…
U listopadu smo nastavili istraživačku suradnji s Prof. dr. M. Heffer s Medicinskog fakulteta Sveučilišta J.J. Strossmayera u Osijeku. U okviru navedene suradnje ispitivan je učinak farmakoterapije na lipidni sastav skeletnih mišića. Na slici su prikazane statističke razlike među izražajima pojedinih m/z signala („feature“) koje su posljedica primjene farmakoterapije. Najveće razlike u izražajima pojedinih m/z…
Tijekom rujna su kolege dr.sc. Dario Mandić, izv.prof.dr.sc. Domagoj Drenjančević, Marijan Orlović i Ana Bandjak posjetile evropsko sjedište tvrtke Bruker Daltonics u Bremenu, Njemačka u svrhu petodnevne edukacije za korištenje MALDI TOF MS/MS uređaja ultrafleXtreme. Tom prilikom kolege su prošle edukaciju iz primjene MALDI TOF MS tehnologije u mikrobiološkoj dijagnostici te edukaciju o primjeni slikovne…
U ponedjeljak, 30.09.2019. godine, u Videokonferencijskoj dvorani Medicinskog fakulteta u Osijeku održana je tiskovna konferencija povodom završetka znanstveno istraživačkog projekta čiji je nositelj KBC Osijek. Projekt pod nazivom Istraživanje i dijagnostika malignih, infektivnih i rijetkih metaboličkih bolesti temeljena na MALDI TOF tehnologiji (MALDI TOF) vrijedan 16.129.024,22 kn sufinanciran je iz sredstava Europskog fonda za regionalni…
U kolovozu 2019. nastavljene su aktivnosti u okviru priprema za provedbu prvih pretkliničkih i kliničkih znanstveno-istraživačkih studija u kojima će primjena MALDI TOF slikovne tehnologije imati značajnu ulogu. Navedene aktivnosti uključuju pripremu tkivnih presjeka te odabir i nanošenje matrice na pripremljene tkivne presjeke. Za nanošenje matrice koristimo uređaj iMLayer tvrtke Shimadzu, Japan. iMLayer: uređaj za…
U srpnju 2019. godine u laborastoriju u zgradi „Maternite“, KBC Osijek provedena je instalacija i evaluacija instrumenta UltrafleXtreme proizvođača Bruker Daltonik, Njemačka. Evaluacijom je utvrđeno je da je instrument ispravno instaliran i potpuno funkcionalan. Instrument je prikazan na slici ispod. Nakon toga je uslijedila petodnevna edukacija koju je proveo ovlašteni serviser Gordan Budić. U okviru…
U lipnju 2019. godine u laboratoriju u zgradi „Maternite“, KBC Osijek je provedena instalacija masenog mikroskopa iMScope Trio tvrtke Shimadzu, Japan nakon čega je, početkom srpnja, slijedila evaluacija instrumenta i petodnevna edukacija koju je provela aplikacijska specijalistica Ann-Christin Niehoff, PhD. Tijekom evaluacije instrumenta je utvrđeno da je instalacija instrumenta ispravno provedena i da je instrument…
Instalacije tekućinskog kromatografa i mikrotoma/kriotoma koje su započele krajem travnja su uspješno završene tijekom svibnja. U svibnju je provedena i instalacija kabineta s laminarnim protokom zraka. Navedeni uređaji omogućavaju sigurnu i prikladnu pripremu bioloških uzoraka za MALDI TOF MS analize. No, najznačajniji događaj je početak instalacije masenog mikroskopa prikazanog na slici koji je započeo početkom…
Tijekom travnja su nastavljeni pregovori sa znanstvenicima iz suradnih ustanova o organizaciji istraživanja koja će se provoditi uz primjenu laboratorijske opreme koja je predmet nabave putem projekta, prvenstveno masenog mikroskopa i MALDI TOF masenog spektrometra. S dr. Jelenom Knežević iz Instituta “Ruđer Bošković”, Zagreb je dogovoreno da će početak suradnje na istraživanju biomarkera karcinoma pluća uključivati MALDI TOF MS…
Glavni cilj projekta je unaprjeđenje znanstveno-istraživačkog rada u KBC Osijek a jedan od preduvjeta za to je suradnja drugim znanstveno-istraživačkim institiucijama. U tom smjeru ide i ugovor o partnerstvu s Institutom za medicinska istraživanja i medicinu rada koji je, krajem veljače, potpisan s ciljem zajedničke prijave na poziv Hrvatske zaklade za znanost pod nazivom „Cooperation…
19.02.2019. KBC Osijek je, s tvrtkom Aparatura d.o.o sklopio ugovor za nabavu MALDI TOF/TOF MS instrumenta UltrafleXtreme proizvođača Bruker Daltonics. Navedeni mjerni instrument ima mogućnost snimanja pojedinih TOF ili TOF/TOF masenih spekatara ali i snimanja bioloških preparata tj tkivnih presjeka. Ovaj instrument omogućava napredno istraživanje i razvoj dijagnostičkih postupaka u mikrobiologiji. Njegovom nabavom je ostvaren…
Prisustvo cirkulirajućih tumorskih stanica predstavlja značajan rizik za bolesnike oboljele od malignih bolesti. Postojeće tehnologije koje se mogu koristiti za njihovu identifikaciju su vrlo ograničene. Glavno ograničenje predstavljaju kemijska svojstva tumorskih stanica koja se razlikuju od bolesnika do bolesnika. Naime, dvije osobe koje boluju od istog patohistološkog tipa tumora ne moraju imati ista molekularna svojstva.…
12. studenog 2018. godine po završetku postupka javne nabave s tvrtkom Shimadzu d.o.o. potpisan je ugovor o nabavi iMScope Trio masenog mikroskopa. Riječ je o prvom od 5 laboratorijskih uređaja od kapitalnog značaja za istraživački rad u KBC Osijek nabavljenom kroz realizaciju projekta “Istraživanje i dijagnostika malignih, infektvnih i rijetkih metaboličkih bolesti temeljena na MALDI…
29.10.2018. u 14 h je održana prezentacija projekta “Istraživanje i dijagnostika malignih, infektivnih i rijetkih metaboličkih bolesti temeljena na MALDI TOF tehnologiji” na Medicinskom fakultetu Sveučilišta JJ Strossmayera u Osijeku. Nakon upoznavanja sudionika s ciljevima projekta i mogućnostima MALDI TOF tehnologije koje je održao Doc.dr. Željko Debeljak potaknuta je rasprava o mogućnostima suradnje znanstvenika Medicinskog…
U četvrtak, 27.09.2018. godine, u videokonferencijskoj dvorani Medicinskog fakulteta u Osijeku održana je tiskovna konferencija znanstveno istraživačkog projekta čiji je nositelj KBC Osijek. Projekt pod nazivom Istraživanje i dijagnostika malignih, infektivnih i rijetkih metaboličkih bolesti temeljena na MALDI TOF tehnologiji (MALDI TOF) vrijedan 16.129.024,22 kn sufinanciran je sredstavima Europskog fonda za regionalni razvoj u okviru…
