U određenim situacijama je potrebno molekule od interesa odvojiti od ostalih molekula prisutnih u uzorku prije negoli ih se identificira primjenom MALDI TOF masene spektrometrije. U tu je svrhu u kolovozu 2020. stavljen u funkciju tekućinski kromatograf (Agilent, USA), još jedan od uređaja nabavljen putem projekta. Na slici je prikazano odvajanje biomarkera metaboličkih bolesti kostiju iz urina.
